シイタケ
Lntinula edods
シウリザクラ
Prunus ssiori
シオクグ：ハマクグ
Carex scabrifolia
シオジ
Fraxinus platypoda
シオン
Aster tataricus
シカ
Cervus nippon
(Deer)
シキミ
Illicium anisatum
(Japanese Anise, Tree)
シダレザクラ(イトザクラ)
Prunus spachiana f. ascendance
シナサワグルミ
Pterocarya stenoptera
シナノガキ（リュウキュウマメガキ）
Diospylos japonica
シナノキ
Tilia japonica
ジバチ、クロスズメバチ
Vespula lewisi
シマテンナンショウ
Arisaema negishii
シャク
ジャケツイバラ
Caesalpinia spiaria var. japonica
Anthriscus aemula
シャシャンポ
Vaccinium bracteatum
ジャノヒゲ、リュウノヒゲ
Ophiopogon japonicus
(Lily, Turf, Sanke' Beard)
シャリンバイ
Rhaphiolepis indica
シュロ
Trachycarpus fortunei
ジュンサイ
Brasenia schreberi
ショウブ
Acorus calamus
(Sweet Flag, Calamus, Sweet Root, Sweet Rush)
ショウロ
Rhizopogon rubescens
シラカシ
Quercus myrsinaefolia
シラカンバ
Betula platyphylla
シラキ
Sapium japonicum
シラタマユリ
Lilium speciosum
シラベ（シラビソ）
Abies veitchii
シラヤマギク
Aster scaber
シラン
Bletilla striata
シリブカガシ
Lithocarpus glabra
シロモジ
Lindera triloba
シロダモ
Neolitsea sericea
シンジュ(ニワウルシ)
Ailanthus altissima
ジンチョウゲ
Daphne odora